第二屆， 2000年10月12日-17日 ，主題（亮點）： 擴大規模，積極探索  ， 出席的中央領導：中共中央政治局委員、 國務院副總理吳邦國。

　　第二屆高交會于2000年10月11日－17日在擴建后的高交會展覽中心舉行。時任國務院副總理吳邦國出席了開幕式并致詞。第二屆高交會的內容由高新技術成果展示與交易、高新技術專業產品展、高新技術論壇三大部分構成。專業產品展新增了“生物技術專業產品展”和“新材料專業產品展”兩個專業展。

　　第三屆， 2001年10月12日-17日， 主題（亮點）：組織實力更強，專業主題更突出  ，出席的中央領導：中共中央政治局候補委員、國務委員吳儀 。

　　2001年10月12日至17日，第三屆高交會在高交會展覽中心和深圳市市民中心舉行。時任國務委員吳儀出席了開幕式并致詞。第三屆高交會的內容由高新技術成果交易、高新技術專業產品展示與交易、高新技術論壇三大部分構成。

　　第四屆， 2002年10月12日-17日 ， 主題（亮點）：國際證券交易機構首次大規模在中國聚會，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記李長春 ，全國人大常委會副委員長周光召。

　　2002年10月12日至17日，第四屆高交會在高交會展覽中心和深圳市市民中心舉行。時任全國人大常委會副委員長周光召出席了開幕式并致詞。第四屆高交會依然由高新技術成果交易、高新技術專業產品展示與交易、高新技術論壇三大部分內容構成。 

　　第五屆， 2003年10月12日-17日 ， 主題（亮點）：著力營造更加安全舒適的展會環境，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理吳儀 。

　　2003年10月12日至17日，第五屆高交會在高交會展覽中心舉行。時任國務院副總理吳儀出席了開幕式并致詞。第五屆高交會主要內容包括“高新技術成果交易”、“高新技術專業產品展”、“中國高新技術論壇”、“super-SUPE系列活動”及“不落幕的交易會”五大部份。

　　第六屆， 2004年10月12日-17日， 主題（亮點）：“國際化”程度越來越高，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理吳儀 。

　　第七屆， 2005年10月12日-17日 ，  主題（亮點）： 自主創新，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理曾培炎 。

　　第七屆屆高交會是一次盛況空前、國際化和自主創新色彩濃厚的高科技盛會。來自世界各地的104個代表團、3464家參展商和1896家投資商參加了展示、交易和洽談。國外23個國家和國際組織、中國內地所有的36個省、自治區、直轄市、計劃單列市和26所高校以及港澳臺地區組團參展參會，國內外65家知名跨國公司參加了展示與交易，專業展海外展區面積所占比例達38%。

　　第八屆， 2006年10月12日-17日，   主題： 自主創新 循環經濟 知識產權保護，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理吳儀 。

　　第八屆高交會是“十一五”規劃和全國科技大會做出自主創新戰略部署和十六屆六中會會做出構建社會主義和諧社會重要決定后首度舉辦的高交會。從新形勢下的國家發展戰略出發，第八屆高交會緊扣科技和經濟發展熱點，突出“自主創新、循環經濟、知識產權保護”三大主題，著力強化四大功能。

　　第九屆， 2007年10月12日-17日 ，  主題： 推進開放創新 保護知識產權 創建和諧社會，  出席的中央領導：全國人大常委會副委員長蔣正華 。

　　第九屆高交會在建設創新型國家的戰略指引下，著力突出“推進開放創新”、“保護知識產權”、“創建和諧社會”三大主題，呈現出濃厚的“開放、創新、和諧”特色。國防科工委自上屆高交會加入高交會主辦單位行列后，首次組團參展；推出了中美“1+3”系列活動。

　　第十屆， 2008年10月12日-17日，   主題： 科技改善民生 創新改變世界，  出席的中央領導：全國人大常委會副委員長桑國衛 。

　　第十一屆， 2009年11月16日-21日 ， 主題： 創新·創業·發展，  出席的中央領導：全國人大常委會副委員長周鐵農 。

　　第十二屆， 2010年11月16日-21日，  主題： 科技引領轉型 創新驅動發展，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、 國務院副總理回良玉 。

　　第十三屆， 2011年11月16日-21日，  主題： 促進國際創新合作 加快發展方式轉變，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記汪洋 。

　　第十四屆， 2012年11月16日-21日，   主題： 推進科技創新 提升發展質量，  出席的中央領導：全國人大常委會副委員長路甬祥 。

　　第十四屆高交會是一屆貫徹落實黨的十八精神，突出創新驅動發展戰略的盛會。第十四屆高交會以“推進科技創新，提升發展質量”為主題，通過一系列的展覽、論壇和活動，突出展示我國以創新驅動發展，取得了令人矚目的豐碩成果。

　　第十五屆 ，2013年11月16日-21日，   主題： 堅持創新驅動發展 提高經濟增長質量，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理汪洋 。

　　第十六屆 ，2014年11月16日-21日，    主題： 堅持創新驅動 加快綠色發展，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、國務院副總理劉延東 。

　　第十六屆高交會總展覽面積達11.5萬平方米，共有包括37個外國團組在內的3016家展商參展，帶來的高新技術項目與產品數達3593項，涵蓋了節能環保、新一代信息技術、生物、高端裝備制造、新能源、新材料、新能源汽車和現代農業等領域。來自83個國家和地區、123個代表團在內的54.6萬人次參會。

　　第十七屆 ，2015年11月16日-21日，    主題： 創新創業 跨界融合，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記胡春華 。

　　第十八屆 ，2016年11月16日-21日，    主題： 創新驅動 質量引領，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記胡春華 。

　　第十九屆 ，2017年11月16日-21日，    主題： 聚焦創新驅動 提升供給質量，  出席的中央領導：中共中央政治局委員、廣東省委書記李希 。